Модели - механизм в определенном смысле более гранулярный, чем XPO-шники. В одной модели может быть один метод или табличное поле, в другой модели - другой метод или табличное поле. При выгрузке XPO весь объект попадает в выгрузку, максимум можно играться слоями. Это может сильно осложнить жизнь при слиянии изменений, если для одного и того же объекта часть изменений надо перенести, а часть - нет.
Кроме того, перенос проектами реально грозит разъехавшимися ID-шниками объектов, особенно тех, что в DataDictionary
Одной из фишек 2012-й является вроде как преодоление проблемы ID-шников объектов -
их пересечения и исчерпания. Частью решения стали ID-шники, специфичные для инсталляции, см. также
The solution to the element ID problem, и при переносе модификаций проектами ID-шники не сохраняются - выделяются новые. Как минимум, это чревато невозможностью
легко и просто перенести затем рабочую базу в тест, потому что в тесте будут совершенно другие ID-шники в SqlDictionary и в полях типа RefTableId. Сразу скажу, что модели тоже не решают эту проблему - надо переносить базу модели целиком.