Лучше всего использовать саппортный подход, т.е. повесить Plug-in на RetrieveMultiple сущности savedquery.
Для того, чтобы удалять системные представления можно использовать уже готовое решение:
http://code.msdn.microsoft.com/crm40hidesystemviews
Там же есть исходники, можно покрутить код и сделать редактирование представления.